机械设备的处理方式多种多样，可以根据设备的新旧程度和技术状况来决定，通常按质论价。如果变价处理收入与账面价值之间存在差额，应依据财务规定进行相应处理，确保处理所得全部作为更新改造资金。
机械设备若因长期使用导致磨损严重，或者因意外事故严重损坏且无法修复，或者达到技术寿命或经济寿命期限，可以考虑报废处理。机械设备的报废条件包括磨损严重，基础件已损坏，大修无法达到使用和要求；技术落后，耗能高，无改造价值；修理费用过高，在经济上不如更新划算；属于淘汰机型，配件无供应等。
符合报废条件的设备需由机械使用单位的技术鉴定组进行申请，并填写设备申请报废申请表。随后，公司机械管理部门将组织相关人员进行检查，确认符合报废条件后，由公司主管部门审批并报财务部门销账。若设备折旧尚未提足，应按财务规定提足折旧。
报废设备不得转让或继续使用，需做好残值回收工作。除了汽车和锅炉外，其他报废设备应集中保管，并进行解体，尽可能利用尚能使用的零部件和总成，作为残值变价收入。未经批准报废的设备，不得随意拆卸零部件。
机械设备的处理应在完成实物清理或交接手续后及时办理财务事宜。若因自然灾害或其他非人力因素导致设备丢失，使用单位需认真清查，并上报财政部门和设备主管部门按相关规定处理。保管不善导致的丢失，则由责任人赔偿部分或全部损失，不得按报废处理。