支付保函和履约保函的区别主要包括以下两个方面：
一、保证责任不同
支付保函，通常也称作预付款保函，是由保证人为施工方向业主提供的，保证人对施工方履行扣还预付款义务的保证。换言之，支付保函的核心是确保预付款能够按照合同规定被合理使用，并在特定条件下退还给业主。
履约保函则是由担保人为施工方向业主提供的，保证施工方将按照合同规定履行其义务。如果施工方未能按时、按质、按量完成合同约定的工程，担保人将承担相应的经济责任。因此，履约保函更侧重于对整个合同履行过程的担保。
二、担保时间不同
支付保函的担保时间通常较短，一般为30-90天，这是因为预付款的扣还通常发生在项目初期，一旦预付款被合理使用或扣还，支付保函的使命也就完成。
相比之下，履约保函的担保时间往往要贯穿整个项目，时间明显更长。这是因为履约保函需要对整个合同的履行过程进行担保，直至工程竣工并验收合格，确保施工方在整个过程中的履约行为。
综上所述，支付保函和履约保函在保证责任和担保时间上存在显著差异。这些差异使得两种保函在工程项目中各自扮演着不同的角色，共同维护着合同的顺利履行和业主的合法权益。